חדש Key אחד לכל המודלים, עם הערכת מחיר לפני כל קריאה. יוצרים Key

GPT
M

medal

קוד פתוח

McGill-NLPunknown2022-03-02

  • disambiguation

מאגר ענק של תקצירי מאמרים רפואיים שנועד לפתרון קיצורים וראשי תיבות לפי הקשר. הוא חוסך איסוף ידני כשרוצים לאמן מודלים שמתמודדים עם כתיבה קלינית ומדעית דחוסה.

  • 376הורדות בחודש
  • 31לייקים

מה זה

המאגר מבוסס על תקצירים מתוך PubMed ו־MEDLINE של הספרייה הלאומית לרפואה בארצות הברית. החוקרים לקחו טקסט רפואי בהיקף של כ־14 מיליון תקצירים, וארגנו אותו סביב משימה אחת: החלפה של מונחים בראשי תיבות כדי ללמד מודלים לשחזר את המילה המקורית הנכונה מתוך כמה אפשרויות קליניות שונות.

המבנה של כל רשומה כולל שלושה שדות: הטקסט המנורמל של התקציר, המיקום של הקיצור שהוחלף בתוך הטקסט, והתווית שמייצגת את המונח המקורי המלא שהיה שם לפני ההחלפה.

הנתונים מחולקים לקובץ המלא שכולל 14 מיליון תקצירים, לצד חלוקות ייעודיות של אימון, אימות ובדיקה ששימשו להערכת המודלים במחקר המקורי.

מתאים ל

  • אימון מקדים לטקסט רפואי

    לימוד ייצוגי שפה על מיליוני תקצירים מדעיים באנגלית לשיפור הבנה של מונחים מורכבים.

  • פתרון ראשי תיבות קליניים

    זיהוי המשמעות המדויקת של קיצור מתוך מספר אפשרויות שונות לפי ההקשר במשפט.

  • בנצ'מרק למודלי שפה ברפואה

    הערכת היכולת של מודלים להתמודד עם הבנת הנקרא וסיווג מונחים במאמרים ביו-רפואיים.

איפה זה נופל

כל הטקסטים נכתבו באנגלית ומגיעים מפרסומים רפואיים אקדמיים, כך שיש כאן הטיה מובהקת למחקר מערבי ואנגלו-צנטרי. אי אפשר להשליך ממנו ישירות על עברית, על תיעוד רפואי מקומי של קופות חולים או על שפות אחרות בלי אימון נוסף. מעבר לזה, הכרטיס לא מפרט מידע על סינון מידע רגיש או פרטי, ומפנה למאמר המקורי בלי להרחיב על תהליך יצירת הקיצורים עצמו.

שאלות
נפוצות

האם מותר להשתמש במאגר לפיתוח מוצר מסחרי?

הרישיון של המאגר אינו מוגדר רשמית, והוא כפוף לתנאי השימוש של PubMed. התנאים דורשים ייחוס מלא ל־NLM ומציינים שחלק מהתקצירים עשויים להיות מוגנים בזכויות יוצרים, ולכן שימוש מסחרי דורש בדיקה משפטית נפרדת.

האם המאגר כולל נתונים בעברית?

לא. כל הנתונים נאספו ממאמרים רפואיים באנגלית בלבד. אם המטרה היא לעבוד עם מסמכים רפואיים בעברית, תצטרכו לאסוף נתונים מקומיים או לבצע אימון המשך על דאטה רלוונטי.

כמה מקום המאגר תופס במחשב?

נפח הנתונים המקורי עמד על 14 ג'יגה בייט וצומצם לכ־4 ג'יגה בייט בגרסה הנוכחית. מומלץ לוודא שיש לכם מספיק זיכרון RAM ושטח אחסון פנוי לקריאת קובצי CSV בגודל הזה.

איך נוצרו התוויות והקיצורים בטקסט?

החוקרים לקחו תקצירים מ־PubMed, איתרו מונחים רפואיים והחליפו אותם בראשי תיבות מתאימים. התווית שומרת את המונח המקורי והמיקום שלו בטקסט, כדי לאפשר למודל ללמוד לחזות את המילה המקורית מתוך ההקשר.

איך טוענים

טוענים את הנתונים דרך ספריית datasets או ישירות מקובצי ה־CSV המכווצים במאגר. הגודל המקורי עמד על 14 ג'יגה בייט וצומצם לכ־4 ג'יגה בייט, כך שצריך לפנות שטח דיסק וזיכרון עבודה מתאים לפני שמתחילים לפרוס אותו. אין צורך בהרשאת גישה מיוחדת או באישור ידני. השדות שמעבדים הם text, location ו־label.

from datasets import load_dataset

ds = load_dataset("McGill-NLP/medal")

הרישיון

הרישיון מוגדר כלא ידוע ברמת המאגר, אבל הטקסטים כפופים ישירות לתנאי השימוש של NLM ו־PubMed. התנאים דורשים מתן קרדיט ברור לספרייה הלאומית לרפואה של ארצות הברית, איסור על רמיזה שהם מאשרים את המוצר שלכם, ואזהרה שחלק מהתקצירים מוגנים בזכויות יוצרים. אסור להניח שמותר להשתמש בזה מסחרית בלי בדיקה משפטית של זכויות היוצרים על התקצירים עצמם.

הרישיון המלא ב־Hugging Face ↗