pxr-challenge
רץ בדפדפןopenadmetרישיון לא דווח2026-03-06
הממשק מנהל את אתגר החיזוי העיוור של OpenADMET סביב הקולטן PXR. הוא מיועד לחוקרים שרוצים להגיש תוצאות חיזוי פעילות או מבנה ולעקוב אחרי טבלת המובילים.
- —הורדות בחודש
- 43לייקים
מה זה
אין כאן מודל שמריץ חיזוי ישיר על מולקולות שתזינו בדפדפן. מדובר במערכת ניהול תחרות שמציגה לוחות תוצאות, בודקת קבצים ומאפשרת להשוות ביצועים בין מודלים שונים שהוגשו לאתגר.
המשתתפים מעלים קובצי תוצאות לאחד משני מסלולים: חיזוי פעילות ביולוגית מסוג EC50, או חיזוי מבנה מרחבי של המולקולה מול הקולטן. בנוסף מזינים פרטי זיהוי כמו שם משתמש, כינוי, פרטי קשר אופציונליים וסימון האם נעשה שימוש במידע קנייני.
הטכנולוגיה מאחורי הדף מבוססת על Gradio שיושב מעל אחסון קבצים ב־S3, טבלאות נתונים של פנדס, ודאטהסט אימון ובדיקה בשם openadmet/pxr-challenge-train-test. הממשק מציג טבלאות דירוג שמתעדכנות מעת לעת, השוואות ראש בראש בין הגשות, וכפתורים להורדת נתוני הטבלאות.
מתאים ל
- הגשת חיזויים לתחרות
העלאת קובצי תוצאות למסלול פעילות EC50 או מסלול מבנה כדי לקבל דירוג רשמי.
- מעקב אחר טבלת המובילים
צפייה בדירוג המשתתפים המתעדכן והורדת נתוני הביצועים של המתחרים.
- השוואת ביצועי מודלים
בחינת תוצאות ראש בראש בין פתרונות שונים שהוגשו למקצה.
איפה זה נופל
אם באתם לחשב פעילות של מולקולה חדשה ולקבל תשובה מיידית, זה לא המקום. האפליקציה רק מקבלת תחזיות שחישבתם בעצמכם במחשב שלכם ומדרגת אותן מול האחרים. אם מבנה הקובץ שגוי או שלא בחרתם מסלול, ההגשה תידחה.
שאלות
נפוצות
האם אפשר להריץ כאן חיזוי על מולקולה שלי?
לא, הממשק אינו מריץ מודלים חישוביים בזמן אמת. הוא משמש לוח תוצאות וטופס קליטה בלבד. את החישובים עצמם עליכם לבצע אצלכם ולהעלות רק את קובץ התוצאות הסופי.
האם השימוש במערכת כרוך בתשלום?
לא, הגישה לדף פתוחה לגמרי בדפדפן ללא תשלום. גם ההשתתפות והגשת הקבצים לאתגר נעשות באופן חופשי. אין כאן מדרגות מחיר או דרישת מנוי.
האם חובה להזדהות בשם אמיתי כדי להגיש?
לא, הטופס כולל אפשרות לסימון הגשה אנונימית וכינוי לבחירתכם. פרטי הקשר כמו שם מלא, שיוך אקדמי ודואל מוגדרים כרשות בלבד. הם נשמרים כמידע פרטי עבור מארגני האתגר.
איזו חומרה מפעילה את האפליקציה הזו?
הדף פועל על תצורת מעבד בסיסית בלבד ללא מאיץ גרפי. מאחר שמדובר בקליטת קבצים והצגת טבלאות, אין צורך בחומרה חזקה יותר. זמני התגובה תלויים רק בטעינת הנתונים.
איך משתמשים
נכנסים לעמוד, בוחרים בלשונית ההגשה, ממלאים שם משתמש, בוחרים מסלול, מעלים קובץ ולוחצים על כפתור ההגשה. המערכת בודקת את תקינות הקובץ ומחזירה הודעת סטטוס או שגיאה. מכיוון שהדף רץ על חומרת מעבד בסיסית, הפעולות מתמצות בעיבוד טפסים והצגת נתונים, כך שאין צורך בכוח חישוב גרפי כבד.
הרישיון
הרישיון לא דווח בקוד הפרויקט. המשמעות היא שאין תנאי שימוש ברורים לשימוש חופשי בקוד, וכדאי לבדוק מול המארגנים מה המעמד המשפטי של קובצי התחזיות שאתם מעלים לפני ששולחים מידע רגיש.